MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 plasmid pDESACI.01

Total Repeats: 1255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018066	TTA	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018066	T	6	6	84	89	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018066	TTTGG	2	10	105	114	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018066	TAAT	2	8	127	134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018066	GAT	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018066	TTA	2	6	200	205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018066	TAG	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018066	TTA	2	6	247	252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423389
9	NC_018066	ATT	2	6	305	310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423389
10	NC_018066	TAA	2	6	316	321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423389
11	NC_018066	TGT	2	6	325	330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423389
12	NC_018066	CTG	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423389
13	NC_018066	CCGA	2	8	425	432	25 %	0 %	25 %	50 %	392423389
14	NC_018066	TC	4	8	578	585	0 %	50 %	0 %	50 %	392423389
15	NC_018066	TCT	2	6	692	697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423389
16	NC_018066	TGC	2	6	703	708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423389
17	NC_018066	GCT	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423390
18	NC_018066	GGA	2	6	1064	1069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423390
19	NC_018066	T	6	6	1070	1075	0 %	100 %	0 %	0 %	392423390
20	NC_018066	TTC	2	6	1111	1116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423390
21	NC_018066	TTC	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423390
22	NC_018066	AAC	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423390
23	NC_018066	TCA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423390
24	NC_018066	TCT	2	6	1274	1279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423390
25	NC_018066	ATTC	2	8	1332	1339	25 %	50 %	0 %	25 %	392423390
26	NC_018066	TCAG	2	8	1345	1352	25 %	25 %	25 %	25 %	392423390
27	NC_018066	GTT	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423390
28	NC_018066	GCT	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423390
29	NC_018066	AGG	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423390
30	NC_018066	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	392423390
31	NC_018066	TTA	2	6	1620	1625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423390
32	NC_018066	TCA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423391
33	NC_018066	ACTC	2	8	1766	1773	25 %	25 %	0 %	50 %	392423391
34	NC_018066	TAA	2	6	1774	1779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423391
35	NC_018066	TAA	2	6	1795	1800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423391
36	NC_018066	ATT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423391
37	NC_018066	AT	3	6	1917	1922	50 %	50 %	0 %	0 %	392423391
38	NC_018066	GAA	2	6	1973	1978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423391
39	NC_018066	TTA	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423391
40	NC_018066	AGA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423391
41	NC_018066	AG	3	6	2191	2196	50 %	0 %	50 %	0 %	392423391
42	NC_018066	CT	3	6	2203	2208	0 %	50 %	0 %	50 %	392423391
43	NC_018066	TGGG	2	8	2246	2253	0 %	25 %	75 %	0 %	392423391
44	NC_018066	ACA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423391
45	NC_018066	T	6	6	2469	2474	0 %	100 %	0 %	0 %	392423391
46	NC_018066	ATA	2	6	2517	2522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423391
47	NC_018066	GTG	2	6	2544	2549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423391
48	NC_018066	GAA	2	6	2573	2578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423391
49	NC_018066	TTGA	2	8	2759	2766	25 %	50 %	25 %	0 %	392423391
50	NC_018066	T	6	6	2833	2838	0 %	100 %	0 %	0 %	392423391
51	NC_018066	GAG	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423391
52	NC_018066	T	6	6	2881	2886	0 %	100 %	0 %	0 %	392423391
53	NC_018066	TCTT	2	8	2963	2970	0 %	75 %	0 %	25 %	392423392
54	NC_018066	TTG	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423392
55	NC_018066	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	392423392
56	NC_018066	ATTA	2	8	3225	3232	50 %	50 %	0 %	0 %	392423392
57	NC_018066	CT	3	6	3267	3272	0 %	50 %	0 %	50 %	392423392
58	NC_018066	GTG	2	6	3284	3289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423392
59	NC_018066	TA	3	6	3301	3306	50 %	50 %	0 %	0 %	392423392
60	NC_018066	T	6	6	3346	3351	0 %	100 %	0 %	0 %	392423392
61	NC_018066	GTT	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423392
62	NC_018066	T	6	6	3379	3384	0 %	100 %	0 %	0 %	392423392
63	NC_018066	T	7	7	3435	3441	0 %	100 %	0 %	0 %	392423392
64	NC_018066	GTC	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423392
65	NC_018066	CAT	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423392
66	NC_018066	GAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423392
67	NC_018066	TTC	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423392
68	NC_018066	GAC	2	6	3702	3707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423392
69	NC_018066	TGA	2	6	3735	3740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423392
70	NC_018066	GAAA	2	8	3742	3749	75 %	0 %	25 %	0 %	392423392
71	NC_018066	ATTTT	2	10	3793	3802	20 %	80 %	0 %	0 %	392423392
72	NC_018066	T	6	6	3799	3804	0 %	100 %	0 %	0 %	392423392
73	NC_018066	TTAT	2	8	3818	3825	25 %	75 %	0 %	0 %	392423392
74	NC_018066	AGG	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423392
75	NC_018066	TTAC	2	8	3980	3987	25 %	50 %	0 %	25 %	392423393
76	NC_018066	GTT	2	6	4085	4090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423393
77	NC_018066	GAA	3	9	4104	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423393
78	NC_018066	T	7	7	4222	4228	0 %	100 %	0 %	0 %	392423393
79	NC_018066	TTCT	2	8	4230	4237	0 %	75 %	0 %	25 %	392423393
80	NC_018066	T	8	8	4323	4330	0 %	100 %	0 %	0 %	392423393
81	NC_018066	ATCT	2	8	4347	4354	25 %	50 %	0 %	25 %	392423393
82	NC_018066	GCA	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423393
83	NC_018066	CAT	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423393
84	NC_018066	TGA	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423393
85	NC_018066	ATT	2	6	4482	4487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423393
86	NC_018066	TAT	2	6	4598	4603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423393
87	NC_018066	TGA	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423393
88	NC_018066	ACT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423393
89	NC_018066	A	6	6	4828	4833	100 %	0 %	0 %	0 %	392423393
90	NC_018066	AGG	2	6	4843	4848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018066	GCA	2	6	4882	4887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423394
92	NC_018066	TATC	2	8	4911	4918	25 %	50 %	0 %	25 %	392423394
93	NC_018066	TGC	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423394
94	NC_018066	TC	3	6	4930	4935	0 %	50 %	0 %	50 %	392423394
95	NC_018066	TTA	2	6	4986	4991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018066	TTA	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018066	AGC	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423395
98	NC_018066	ATT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423395
99	NC_018066	ATT	2	6	5136	5141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423395
100	NC_018066	TTC	2	6	5186	5191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423395
101	NC_018066	ACC	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423395
102	NC_018066	T	9	9	5275	5283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018066	T	7	7	5289	5295	0 %	100 %	0 %	0 %	392423396
104	NC_018066	TTTA	2	8	5309	5316	25 %	75 %	0 %	0 %	392423396
105	NC_018066	TTA	2	6	5431	5436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423396
106	NC_018066	GTT	2	6	5451	5456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423396
107	NC_018066	AAGTA	2	10	5469	5478	60 %	20 %	20 %	0 %	392423396
108	NC_018066	TAA	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018066	AGG	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018066	ACA	2	6	5545	5550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018066	GTT	2	6	5557	5562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018066	CGC	2	6	5580	5585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018066	AATT	2	8	5636	5643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018066	A	8	8	5650	5657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018066	ACA	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018066	GAT	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018066	CGA	2	6	5834	5839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423397
118	NC_018066	CAAT	2	8	5865	5872	50 %	25 %	0 %	25 %	392423397
119	NC_018066	GACA	2	8	5874	5881	50 %	0 %	25 %	25 %	392423397
120	NC_018066	GCAA	2	8	5886	5893	50 %	0 %	25 %	25 %	392423397
121	NC_018066	TTTA	2	8	5946	5953	25 %	75 %	0 %	0 %	392423397
122	NC_018066	ATA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423397
123	NC_018066	AGC	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423397
124	NC_018066	AAT	3	9	6170	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423397
125	NC_018066	CTT	2	6	6186	6191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423397
126	NC_018066	AAGC	2	8	6317	6324	50 %	0 %	25 %	25 %	392423397
127	NC_018066	G	7	7	6328	6334	0 %	0 %	100 %	0 %	392423397
128	NC_018066	CTT	2	6	6393	6398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423397
129	NC_018066	TTA	2	6	6462	6467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423398
130	NC_018066	ATT	2	6	6492	6497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423398
131	NC_018066	TAA	2	6	6586	6591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423398
132	NC_018066	TCT	2	6	6621	6626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423398
133	NC_018066	TTA	2	6	6678	6683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423398
134	NC_018066	T	6	6	6726	6731	0 %	100 %	0 %	0 %	392423398
135	NC_018066	ATGT	2	8	6736	6743	25 %	50 %	25 %	0 %	392423398
136	NC_018066	GTTT	2	8	6747	6754	0 %	75 %	25 %	0 %	392423398
137	NC_018066	AAT	2	6	6884	6889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018066	TAT	2	6	6917	6922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018066	ATT	2	6	7003	7008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018066	AGC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018066	CAG	2	6	7216	7221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018066	AAG	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018066	TTTG	2	8	7346	7353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018066	TTC	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018066	AGGG	2	8	7436	7443	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_018066	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018066	TATT	2	8	7829	7836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018066	GAT	2	6	7898	7903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423400
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175	NC_018066	A	6	6	8838	8843	100 %	0 %	0 %	0 %	392423402
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403	NC_018066	A	6	6	20015	20020	100 %	0 %	0 %	0 %	392423410
404	NC_018066	GCA	2	6	20061	20066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423410
405	NC_018066	CAT	2	6	20239	20244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423410
406	NC_018066	AGC	2	6	20273	20278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423410
407	NC_018066	ATA	2	6	20285	20290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423410
408	NC_018066	TTGC	2	8	20318	20325	0 %	50 %	25 %	25 %	392423410
409	NC_018066	GC	3	6	20324	20329	0 %	0 %	50 %	50 %	392423410
410	NC_018066	AGCA	2	8	20341	20348	50 %	0 %	25 %	25 %	392423410
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421	NC_018066	TTGAA	2	10	20823	20832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
422	NC_018066	TTTA	2	8	20871	20878	25 %	75 %	0 %	0 %	392423411
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431	NC_018066	T	7	7	21329	21335	0 %	100 %	0 %	0 %	392423411
432	NC_018066	TAT	2	6	21384	21389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423411
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434	NC_018066	TA	3	6	21540	21545	50 %	50 %	0 %	0 %	392423411
435	NC_018066	A	7	7	21590	21596	100 %	0 %	0 %	0 %	392423411
436	NC_018066	AT	3	6	21630	21635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_018066	A	6	6	21717	21722	100 %	0 %	0 %	0 %	392423412
438	NC_018066	TAT	2	6	21770	21775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423412
439	NC_018066	T	6	6	21775	21780	0 %	100 %	0 %	0 %	392423412
440	NC_018066	TTGT	2	8	21881	21888	0 %	75 %	25 %	0 %	392423412
441	NC_018066	ATT	2	6	21906	21911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423412
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446	NC_018066	TACT	2	8	22068	22075	25 %	50 %	0 %	25 %	392423413
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481	NC_018066	TCC	2	6	23637	23642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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493	NC_018066	TGA	2	6	24015	24020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_018066	T	6	6	24189	24194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_018066	CTATA	2	10	24228	24237	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
500	NC_018066	AGG	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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